亚历山大学院和大公会议

研究过第一次大公会议（尼西亚会议）的学者们都了解，参加该会议的亚历山大的神学家们是基督信仰的先导者。

当罗马皇帝接受了基督信仰并停止了对基督徒的迫害之后，异端学说开始蠢蠢欲动，例如亚流，聂斯脱里等。对于亚历山大的主教们来说，打击异端并确立正确的 基督教教义势在必行，他们之中的佼佼者有：

圣亚他那修（Pope Athanasius the Apostolic and the Council of Nicea)和尼西亚会议

他是基 督教史上的伟人，在328年他继亚历山大出任教皇。在位四十六年，期间 曾因反对被罗马皇帝所支持的亚流主义而受到迫害并被贬黜，曾被流放五次，前后长达十七年。在公元325年的尼西亚会议中，攻击亚流主义，最后确立了主耶稣 基督和天父上帝是同一本质和平等的思想，为传统基督教教义三位一体的发展奠下历史性基础。他也是第一个列出今天《圣经·新约》正典书目的人。

亚 流主义否认主耶稣基督的神性，认为圣子是最初被造的，是上帝与人之间的媒介。而亚历山大的主教和教父们则认为独一的真神拥有三个位格，圣父，圣子和圣灵且 为一体。因此，在325年举行了第一次尼西亚会议。此次会议是由罗马皇帝君士坦丁召集召开，共有118位主教参加，圣亚他那修陪同当时的教皇亚历山大出 席。

那 时，他只是一位普通的教会执事，不具备参加会议的资格。据说教皇为了使他能够出席该会议，特按立其为神父。圣亚他那修凭借着坚定的信仰和丰富的神学知识与 亚流派众人展开激烈的辩论，会议最后的决定完全拒绝了亚流的教导，将其判为异端，并撰写了尼西亚信经。尼西亚信经的写成，圣亚他那修是最重要的人 物。

教皇提莫西（Pope Timothy）和君士坦丁堡公会议

第二次大公会议于公元381年在君士坦丁堡举行，由狄奥多西一世召集召开。此次会议共有150位大主教参加，针对以马赛道尼（Macedonius）为首的敌圣灵派（否认圣灵的神性，认为圣灵是受造的）。他是亚流派的支持者并试图成为君士坦丁堡的大主教。

教皇提莫西在此次会议中至关重要，据基督教史学家索宗曼（Sozomen）的记载，他主持了该会议。

教皇区利罗一世（Pope Cyril the Great）和聂斯脱里主义

在公元431年的6月22日，第三次大公会议在以弗所召开，由狄奥多西斯二世召集召开。将近两百位大主教参加了此次会议，圣区利罗一世，亚历山大教皇出席并主持了会议。其主要议题是关于君士坦丁堡大主教聂斯托里对 于主耶稣基督的神性和人性的争论（即主耶稣基督分成神人两性，且过分强调基督的人性并淡化神性）。圣区利罗则一再强调主耶稣基督的神性和人性不可分割。同 时，他也强调了圣母玛利亚的圣母头衔（Theotokos）。确认了童贞女玛利亚为天主之母，主耶稣基督因神由童贞女玛利亚而道成肉身。